Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ABCF3Q9NUQ8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms