Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LMBRD1Q9NUN5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LMBRD1Q9NUN5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms