Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC31■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC31■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC30.97■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms