Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLE3Q9NRF9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
POLE3Q9NRF9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLE3Q9NRF9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLE3Q9NRF9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLE3Q9NRF9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLE3Q9NRF9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLE3Q9NRF9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLE3Q9NRF9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLE3Q9NRF9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLE3Q9NRF9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLE3Q9NRF9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLE3Q9NRF9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLE3Q9NRF9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLE3Q9NRF9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLE3Q9NRF9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLE3Q9NRF9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLE3Q9NRF9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLE3Q9NRF9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLE3Q9NRF9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLE3Q9NRF9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLE3Q9NRF9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLE3Q9NRF9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLE3Q9NRF9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLE3Q9NRF9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLE3Q9NRF9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLE3Q9NRF9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLE3Q9NRF9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
POLE3Q9NRF9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLE3Q9NRF9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLE3Q9NRF9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLE3Q9NRF9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLE3Q9NRF9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLE3Q9NRF9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLE3Q9NRF9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms