Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW8

CNGB3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, humanhuman

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Length 809 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB3Q9NQW8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
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