Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms