Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms