Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC52A2Q9HAB3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC52A2Q9HAB3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC52A2Q9HAB3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC52A2Q9HAB3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC52A2Q9HAB3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC52A2Q9HAB3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC52A2Q9HAB3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC52A2Q9HAB3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC52A2Q9HAB3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC52A2Q9HAB3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC52A2Q9HAB3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC52A2Q9HAB3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC52A2Q9HAB3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC52A2Q9HAB3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC52A2Q9HAB3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC52A2Q9HAB3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC52A2Q9HAB3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC52A2Q9HAB3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC52A2Q9HAB3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC52A2Q9HAB3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC52A2Q9HAB3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC52A2Q9HAB3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC52A2Q9HAB3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC52A2Q9HAB3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC52A2Q9HAB3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC52A2Q9HAB3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC52A2Q9HAB3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC52A2Q9HAB3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC52A2Q9HAB3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC52A2Q9HAB3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC52A2Q9HAB3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC52A2Q9HAB3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC52A2Q9HAB3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms