Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9T3

ELP3, Elongator complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP3Q9H9T3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ELP3Q9H9T3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ELP3Q9H9T3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
ELP3Q9H9T3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
ELP3Q9H9T3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ELP3Q9H9T3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ELP3Q9H9T3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ELP3Q9H9T3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms