Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 ATG10-IT1-201ENST00000396880 487 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 AC012181.2-201ENST00000570210 699 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 AC092964.1-201ENST00000623304 1399 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 PSMG2-210ENST00000590217 1036 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 AL117378.2-201ENST00000622916 1337 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 AC012309.1-203ENST00000585860 965 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms