Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C0

GAN, Gigaxonin, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GANQ9H2C0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GANQ9H2C0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GANQ9H2C0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GANQ9H2C0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GANQ9H2C0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GANQ9H2C0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GANQ9H2C0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GANQ9H2C0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GANQ9H2C0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GANQ9H2C0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GANQ9H2C0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GANQ9H2C0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GANQ9H2C0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GANQ9H2C0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GANQ9H2C0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GANQ9H2C0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GANQ9H2C0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GANQ9H2C0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GANQ9H2C0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GANQ9H2C0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms