Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT8

NIF3L1, NIF3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIF3L1Q9GZT8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms