Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CNTNAP4Q9C0A0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNTNAP4Q9C0A0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNTNAP4Q9C0A0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNTNAP4Q9C0A0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNTNAP4Q9C0A0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNTNAP4Q9C0A0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms