Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms