Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.1 ms