Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV8

CEP41, Centrosomal protein of 41 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP41Q9BYV8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CEP41Q9BYV8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms