Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms