Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms