Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS8

LARP6, La-related protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP6Q9BRS8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LARP6Q9BRS8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms