Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms