Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms