Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB3IPQ96QF0 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB3IPQ96QF0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB3IPQ96QF0 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB3IPQ96QF0 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB3IPQ96QF0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB3IPQ96QF0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB3IPQ96QF0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3IPQ96QF0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3IPQ96QF0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3IPQ96QF0 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3IPQ96QF0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3IPQ96QF0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3IPQ96QF0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3IPQ96QF0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3IPQ96QF0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3IPQ96QF0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3IPQ96QF0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3IPQ96QF0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3IPQ96QF0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3IPQ96QF0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3IPQ96QF0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3IPQ96QF0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3IPQ96QF0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3IPQ96QF0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3IPQ96QF0 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3IPQ96QF0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3IPQ96QF0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3IPQ96QF0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3IPQ96QF0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3IPQ96QF0 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3IPQ96QF0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB3IPQ96QF0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB3IPQ96QF0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB3IPQ96QF0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB3IPQ96QF0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB3IPQ96QF0 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB3IPQ96QF0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB3IPQ96QF0 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB3IPQ96QF0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB3IPQ96QF0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB3IPQ96QF0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB3IPQ96QF0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB3IPQ96QF0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB3IPQ96QF0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB3IPQ96QF0 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB3IPQ96QF0 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB3IPQ96QF0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB3IPQ96QF0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB3IPQ96QF0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB3IPQ96QF0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB3IPQ96QF0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB3IPQ96QF0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms