Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
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