Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms