Protein–RNA interactions for Protein: Q96NG5

ZNF558, Zinc finger protein 558, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF558Q96NG5 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms