Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms