Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP47Q96K76 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP47Q96K76 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP47Q96K76 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP47Q96K76 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP47Q96K76 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP47Q96K76 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP47Q96K76 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP47Q96K76 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP47Q96K76 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP47Q96K76 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
USP47Q96K76 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP47Q96K76 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP47Q96K76 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP47Q96K76 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP47Q96K76 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP47Q96K76 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP47Q96K76 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP47Q96K76 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP47Q96K76 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP47Q96K76 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP47Q96K76 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
USP47Q96K76 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP47Q96K76 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP47Q96K76 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
USP47Q96K76 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
USP47Q96K76 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
USP47Q96K76 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
USP47Q96K76 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms