Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms