Protein–RNA interactions for Protein: Q96F07

CYFIP2, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP2Q96F07 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYFIP2Q96F07 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYFIP2Q96F07 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYFIP2Q96F07 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYFIP2Q96F07 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYFIP2Q96F07 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYFIP2Q96F07 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYFIP2Q96F07 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYFIP2Q96F07 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYFIP2Q96F07 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYFIP2Q96F07 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYFIP2Q96F07 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYFIP2Q96F07 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYFIP2Q96F07 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYFIP2Q96F07 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYFIP2Q96F07 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYFIP2Q96F07 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYFIP2Q96F07 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYFIP2Q96F07 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYFIP2Q96F07 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYFIP2Q96F07 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYFIP2Q96F07 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYFIP2Q96F07 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYFIP2Q96F07 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYFIP2Q96F07 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYFIP2Q96F07 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYFIP2Q96F07 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYFIP2Q96F07 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYFIP2Q96F07 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYFIP2Q96F07 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYFIP2Q96F07 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYFIP2Q96F07 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYFIP2Q96F07 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms