Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RRP36Q96EU6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms