Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms