Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB5

RMDN1, Regulator of microtubule dynamics protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN1Q96DB5 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RMDN1Q96DB5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RMDN1Q96DB5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RMDN1Q96DB5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RMDN1Q96DB5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RMDN1Q96DB5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RMDN1Q96DB5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RMDN1Q96DB5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RMDN1Q96DB5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RMDN1Q96DB5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RMDN1Q96DB5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RMDN1Q96DB5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RMDN1Q96DB5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RMDN1Q96DB5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RMDN1Q96DB5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RMDN1Q96DB5 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RMDN1Q96DB5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RMDN1Q96DB5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RMDN1Q96DB5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RMDN1Q96DB5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RMDN1Q96DB5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RMDN1Q96DB5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RMDN1Q96DB5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RMDN1Q96DB5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RMDN1Q96DB5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RMDN1Q96DB5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RMDN1Q96DB5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RMDN1Q96DB5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RMDN1Q96DB5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RMDN1Q96DB5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RMDN1Q96DB5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RMDN1Q96DB5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RMDN1Q96DB5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RMDN1Q96DB5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RMDN1Q96DB5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RMDN1Q96DB5 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RMDN1Q96DB5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RMDN1Q96DB5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RMDN1Q96DB5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RMDN1Q96DB5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RMDN1Q96DB5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RMDN1Q96DB5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RMDN1Q96DB5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RMDN1Q96DB5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RMDN1Q96DB5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RMDN1Q96DB5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RMDN1Q96DB5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RMDN1Q96DB5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RMDN1Q96DB5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RMDN1Q96DB5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
RMDN1Q96DB5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RMDN1Q96DB5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RMDN1Q96DB5 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RMDN1Q96DB5 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RMDN1Q96DB5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RMDN1Q96DB5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RMDN1Q96DB5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RMDN1Q96DB5 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RMDN1Q96DB5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RMDN1Q96DB5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RMDN1Q96DB5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RMDN1Q96DB5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RMDN1Q96DB5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RMDN1Q96DB5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RMDN1Q96DB5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RMDN1Q96DB5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RMDN1Q96DB5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RMDN1Q96DB5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RMDN1Q96DB5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RMDN1Q96DB5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RMDN1Q96DB5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RMDN1Q96DB5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RMDN1Q96DB5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RMDN1Q96DB5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RMDN1Q96DB5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RMDN1Q96DB5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RMDN1Q96DB5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RMDN1Q96DB5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RMDN1Q96DB5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RMDN1Q96DB5 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RMDN1Q96DB5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RMDN1Q96DB5 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RMDN1Q96DB5 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RMDN1Q96DB5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RMDN1Q96DB5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RMDN1Q96DB5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RMDN1Q96DB5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RMDN1Q96DB5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RMDN1Q96DB5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RMDN1Q96DB5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RMDN1Q96DB5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RMDN1Q96DB5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RMDN1Q96DB5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RMDN1Q96DB5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RMDN1Q96DB5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RMDN1Q96DB5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RMDN1Q96DB5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RMDN1Q96DB5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RMDN1Q96DB5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RMDN1Q96DB5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms