Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms