Protein–RNA interactions for Protein: Q92989

CLP1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLP1Q92989 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms