Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DNAAF4Q8WXU2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DNAAF4Q8WXU2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DNAAF4Q8WXU2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DNAAF4Q8WXU2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DNAAF4Q8WXU2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DNAAF4Q8WXU2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DNAAF4Q8WXU2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms