Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms