Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFZ8

CADM4, Cell adhesion molecule 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM4Q8NFZ8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CADM4Q8NFZ8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms