Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC148Q8NFR7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC148Q8NFR7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC148Q8NFR7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC148Q8NFR7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC148Q8NFR7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC148Q8NFR7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC148Q8NFR7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC148Q8NFR7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC148Q8NFR7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC148Q8NFR7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms