Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms