Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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FAM71DQ8N9W8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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FAM71DQ8N9W8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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FAM71DQ8N9W8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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FAM71DQ8N9W8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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FAM71DQ8N9W8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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FAM71DQ8N9W8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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FAM71DQ8N9W8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
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