Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MSL3Q8N5Y2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MSL3Q8N5Y2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MSL3Q8N5Y2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MSL3Q8N5Y2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MSL3Q8N5Y2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MSL3Q8N5Y2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MSL3Q8N5Y2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MSL3Q8N5Y2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MSL3Q8N5Y2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MSL3Q8N5Y2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MSL3Q8N5Y2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MSL3Q8N5Y2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MSL3Q8N5Y2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MSL3Q8N5Y2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MSL3Q8N5Y2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MSL3Q8N5Y2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MSL3Q8N5Y2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MSL3Q8N5Y2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSL3Q8N5Y2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSL3Q8N5Y2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSL3Q8N5Y2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSL3Q8N5Y2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSL3Q8N5Y2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSL3Q8N5Y2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSL3Q8N5Y2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSL3Q8N5Y2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSL3Q8N5Y2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSL3Q8N5Y2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSL3Q8N5Y2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSL3Q8N5Y2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSL3Q8N5Y2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MSL3Q8N5Y2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSL3Q8N5Y2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSL3Q8N5Y2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MSL3Q8N5Y2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSL3Q8N5Y2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSL3Q8N5Y2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSL3Q8N5Y2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSL3Q8N5Y2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSL3Q8N5Y2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSL3Q8N5Y2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MSL3Q8N5Y2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MSL3Q8N5Y2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MSL3Q8N5Y2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MSL3Q8N5Y2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MSL3Q8N5Y2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MSL3Q8N5Y2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MSL3Q8N5Y2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MSL3Q8N5Y2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MSL3Q8N5Y2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MSL3Q8N5Y2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MSL3Q8N5Y2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MSL3Q8N5Y2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms