Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYR2

SMYD4, SET and MYND domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD4Q8IYR2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms