Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVH2

FOXP4, Forkhead box protein P4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP4Q8IVH2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FOXP4Q8IVH2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXP4Q8IVH2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXP4Q8IVH2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXP4Q8IVH2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXP4Q8IVH2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXP4Q8IVH2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXP4Q8IVH2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXP4Q8IVH2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXP4Q8IVH2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXP4Q8IVH2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXP4Q8IVH2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXP4Q8IVH2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXP4Q8IVH2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXP4Q8IVH2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXP4Q8IVH2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXP4Q8IVH2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXP4Q8IVH2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXP4Q8IVH2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXP4Q8IVH2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXP4Q8IVH2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXP4Q8IVH2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXP4Q8IVH2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXP4Q8IVH2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXP4Q8IVH2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXP4Q8IVH2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXP4Q8IVH2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXP4Q8IVH2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXP4Q8IVH2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXP4Q8IVH2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXP4Q8IVH2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms