Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU68

TMC8, Transmembrane channel-like protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC8Q8IU68 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMC8Q8IU68 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMC8Q8IU68 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMC8Q8IU68 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMC8Q8IU68 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMC8Q8IU68 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMC8Q8IU68 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMC8Q8IU68 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMC8Q8IU68 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TMC8Q8IU68 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMC8Q8IU68 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMC8Q8IU68 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMC8Q8IU68 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMC8Q8IU68 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMC8Q8IU68 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMC8Q8IU68 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMC8Q8IU68 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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