Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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