Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBE3BQ7Z3V4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBE3BQ7Z3V4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms