Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q71RC1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q71RC1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q71RC1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q71RC1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q71RC1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q71RC1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q71RC1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Q71RC1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q71RC1 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q71RC1 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q71RC1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q71RC1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Q71RC1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q71RC1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q71RC1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q71RC1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q71RC1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q71RC1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q71RC1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q71RC1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q71RC1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q71RC1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q71RC1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q71RC1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q71RC1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q71RC1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q71RC1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q71RC1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q71RC1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q71RC1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q71RC1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q71RC1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q71RC1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q71RC1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q71RC1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q71RC1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q71RC1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q71RC1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q71RC1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q71RC1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q71RC1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q71RC1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q71RC1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q71RC1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q71RC1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q71RC1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q71RC1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q71RC1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q71RC1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q71RC1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q71RC1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Q71RC1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q71RC1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q71RC1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q71RC1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Q71RC1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q71RC1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q71RC1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Q71RC1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q71RC1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q71RC1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q71RC1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q71RC1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q71RC1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Q71RC1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q71RC1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q71RC1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q71RC1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q71RC1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q71RC1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q71RC1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q71RC1 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q71RC1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Q71RC1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q71RC1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Q71RC1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Q71RC1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Q71RC1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q71RC1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q71RC1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q71RC1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q71RC1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q71RC1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q71RC1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q71RC1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q71RC1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q71RC1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q71RC1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q71RC1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q71RC1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q71RC1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q71RC1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q71RC1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q71RC1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q71RC1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q71RC1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q71RC1 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q71RC1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q71RC1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms