Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms