Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM72Q6ZMU5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM72Q6ZMU5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM72Q6ZMU5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM72Q6ZMU5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM72Q6ZMU5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM72Q6ZMU5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM72Q6ZMU5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM72Q6ZMU5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM72Q6ZMU5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM72Q6ZMU5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM72Q6ZMU5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM72Q6ZMU5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM72Q6ZMU5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM72Q6ZMU5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM72Q6ZMU5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM72Q6ZMU5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM72Q6ZMU5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM72Q6ZMU5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM72Q6ZMU5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM72Q6ZMU5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM72Q6ZMU5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM72Q6ZMU5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM72Q6ZMU5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM72Q6ZMU5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM72Q6ZMU5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM72Q6ZMU5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM72Q6ZMU5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM72Q6ZMU5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM72Q6ZMU5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM72Q6ZMU5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM72Q6ZMU5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM72Q6ZMU5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM72Q6ZMU5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM72Q6ZMU5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM72Q6ZMU5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM72Q6ZMU5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM72Q6ZMU5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM72Q6ZMU5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM72Q6ZMU5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM72Q6ZMU5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM72Q6ZMU5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM72Q6ZMU5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM72Q6ZMU5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM72Q6ZMU5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM72Q6ZMU5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM72Q6ZMU5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM72Q6ZMU5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM72Q6ZMU5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM72Q6ZMU5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM72Q6ZMU5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM72Q6ZMU5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM72Q6ZMU5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM72Q6ZMU5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM72Q6ZMU5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM72Q6ZMU5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms