Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ANKRD54Q6NXT1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms